Ja, klar würde ich clickern beim Führen. Und nicht das Übermutsproblem meiden, in dem ich das Futter weglasse, sondern erst mal die klassischen "Selbstbeherrschungsübungen" mit dem Pferd machen. (Zurücktreten fürs Futter, Kopf geradeaus, Menschen nicht bekrabbeln, auf allen vier Beinen stehen, keine Schlenkerei, Kopfsenken...)
Dazu braucht man oft nicht mal Halfter und Strick, das geht im Vorbeilaufen in Mini-Einheiten. Die Trennung durch einen Zaun hat man da meist auch gleich dabei und kann gehen, wenn's zu heftig wird.
Separieren würde ich anfangen, wenn sie mal nicht mehr so durchknallt im Angesicht des Futterbeutels. Dann kann man schon 10-15 Minuten was machen - eben weil das Kleintier nicht mehr die Psycho-Krise dabei kriegt.
Ich denke dabei auch an die frechen Isi-Fohlen, die Euch die nächsten 2 Jahre begleiten werden und an die älteren Stuten. Mir wäre das zu blöd, immer mit anderen Pferden drumherum zu trainieren, wenn die teilweise auch noch aufschaffen, sobald es um Futter geht.